当铁碳微电解填料在酸性废水不断被腐蚀变成铁屑或铁粉时，这些微小的沉积金属粉粒也一起随废水流出，而在后续的碱中和絮凝沉淀时一同被分离去除。

同样，其他氧化性较强的离子或化合物也会被铁或亚铁离子还原成毒性较小的还原态。新生态的二价铁离子可使某些有机物的发色基团如硝基-NO2、亚硝基-NO还原成氨基-NH2，氨基类有机物的可生化性明显高于硝基类有机物可使某些不饱和发色基团(如羧基-COOH、偶氮基-N=N—)的双键打开，使发色基团破坏而除去色度，使部分难降解环状和长链有机物分解成易生物降解的小分子有机物而提高可生化性。

电化学反应中产生的新生态氢[H]具有较大的活性，能破坏发色物质的发色结构，使废水中某些有机物的发色基团和助色基团破裂，大分子分解为小分子，达到脱色的目的，同时使废水的组成向易于生化的方向转变。铁碳微电解系统对废水中许多有毒物质、难降解物质的直接还原，使之毒性减弱或完全降解，这样可 以大幅度提高难降解工业废水的可生化’性，便于后续生化处理。