铁碳填料在运行前后也需要注意几个方面的问题，这样才能达到的处理效果。废水的预处理：充分发挥铁碳填料的各种作用，应结合污水处理各个工艺环节，除去废水中的油脂类、SS，为微电解处理系统提供稳定运行的条件。

PH值调节：铁碳填料处理废水应在弱酸性、富氧的条件下运行。pH值应该调节到3左右，过高则会加快铁碳填料的消耗，造成浪费，提高了成本。过低则反应条件不够，不能充分去除水中的各种污染物。曝气充氧：在铁碳填料处理废水的过程中，通过曝气为其可提供充足的氧气，从而促进原电池效应反应的进行。另一方面，通过曝气对废水起到搅拌震荡的作用，在减弱浓差极化，加速电极反应的进行的同时，通过曝气的剪切力，使填料表面及时得到更新，提高了废水与填料的传质效率。曝气的时间、曝气量的大小可根据处理废水的水质不同确定，一般曝气时间控制1~2小时、曝气量适中即可。废水经铁碳填料处理后，废水中溶于水的污染物在铁碳填料作用下，分子状态发生变化，从废水中析出。向废水中投加石灰乳调节PH值至8-9之间，加入适量助凝剂（如：PAC、Pam等）进行絮凝沉淀，将废水中析出的不溶物和胶体有机物沉淀去除。

对于较难处理的废水，可考虑在微电解工艺之后投加H2O2，利用微电解过程产生的Fe+2作为催化剂，形成氧化性极强的FenTon试剂，将废水中有机物氧化为CO2和H2O或其他